Lequile sarebbe stata fondata in epoca romana, quando si stabilì nella zona il centurione Leculo, il quale vi eresse una villa da cui sorse poi un villaggio.

Il centro fece parte, dal secolo XI sino al 1463, della Contea di Lecce e del Principato di Taranto.

Si susseguirono varie famiglie al potere: i Brienne e poi via via i Bonomine, i de Marco, i Sambiase, i Santabarbara e i Marescallo. Nel 1433 Maria d’Enghien la concesse in feudo al Guarino, barone di San Cesario, che ne detenne la proprietà fino al 1531.