Arnesano deriva probabilmente dal latino Arnisius, centurione romano Armisio, cui furono assegnate queste terre.

Recentemente, fonti autorevoli, ritengono che il nome Arnesano derivi da Arna che significa "concavità" proprio in relazione alla peculiare morfologia dell'agglomerato urbano.

Negli anni sessanta, nella frazione Riesci, è stata scoperta una sepoltura del tardo Neolitico (2400 a.C.)che ne evidenzia l'antichissima ed intensa antropizzazione della zona.

Appartenuta al Contado di Lecce, passò per un breve periodo ai Caracciolo, e successivamente agli Orsini del Balzo; quindi al de Ferrante d’Aragona, al Guidano da Galatina, a Mariotto Corso, al Marescallo, ai signori Prato di Lecce, ed infine alla famiglia Bernardini.